Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MVDP53602 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MVDP53602 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MVDP53602 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MVDP53602 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MVDP53602 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MVDP53602 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MVDP53602 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MVDP53602 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms