Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF135P52742 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms