Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA4P43681 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms