Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLD1P28340 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms