Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms