Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA1P25391 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms