Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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