Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCBP10092 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCBP10092 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms