Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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VEGFDO43915 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFDO43915 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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