Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E9PBE3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms