Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms