Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms