Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms