Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms