Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms