Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms