Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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