Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms