Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms