Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT27Q9BW83 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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