Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LPIN3Q9BQK8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LPIN3Q9BQK8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms