Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF6BQ99941 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms