Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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GTF3C6Q969F1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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GTF3C6Q969F1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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