Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRIPQ8WXE1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms