Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP4Q8N2S1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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