Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDXQ7Z353 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms