Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A10Q6U841 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms