Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms