Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNS3Q68CZ2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms