Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms