Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms