Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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