Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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