Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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