Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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