Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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