Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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