Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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