Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMK2BQ13554 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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