Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms