Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME3Q13232 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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