Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms