Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms