Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNB3Q05901 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNB3Q05901 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms