Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms