Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2NP61088 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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