Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBP60709 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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