Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms