Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms