Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LUMP51884 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LUMP51884 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms